Se han registrado sobre 20 especies de anfibios y reptiles, donde el 40% son endémicos de la región zoogeográfica tropical suroccidental del Ecuador (Díaz y Baus, 2001). La presencia de 6 especies de serpientes (entre ellas Boa constrictor imperator, Boa constrictor ortoni, Drymarchon melanurus, Leptodeira septentrionalis, Liophis sp.) demuestra también el mantenimiento de relaciones predador-presa y la salud ecosistémica.