La reserva está situada al suroccidente de la provincia de Loja, en el cantón Zapotillo (ver mapa).  Se localiza a 16 km de la ciudad de Zapotillo, y se accede a ella mediante la vía de tercer orden Zapotillo-Malvas, la cual es generalmente intransitable durante el período de invierno, debido al incremento de caudal en el río Alamor y las quebradas aledañas al camino.

La RNLC , tiene una extensión de 7000 ha, alcanzando aproximadamente 600 msnm en su parte alta (noroeste del área en la cordillera Arañitas), y 200 msnm en la parte baja (quebrada de Chiquerito). Se extiende a lo largo, entre la cordillera de Cabeza de Toro en el Este y la quebrada Pilares al oeste, límite con el Perú; por el norte lindera con la comunidad de Revolcaderos; y por el sur con la hacienda Romeros en el Ecuador.